《神秘代码》主要讲述身为教师的主人公，在儿子就读的学校里发现了一个来自过去的时间囊，时间囊中有一些图画文件之类的东西，上面写着对未来世界的预言。最可怕的是它预言地球即将毁灭，主人公被迫在有限的时间内采取行动，以阻止预言的实现 。